只不过，在脱离危险后，雷普莉就马上用喷火器毁掉了异形皇后的巢穴。

火焰中，大量的异形卵被烧毁，愤怒的异形皇后脱离了自己的子宫去追杀雷普莉，而生化人这个时候却返回，即使的救走了雷普莉和小女孩，他们引爆核弹毁掉了异形的巢穴。

故事当然不会就此成为圆满大结局，异形皇后混上了飞船重伤了生化人。雷普莉驾驶装卸用的机器和异形皇后进行战斗，并故技重施，打开飞船的舱门将异形皇后抛入了太空中。

最后的幸存者，包括雷普莉在内的三个人再加上一个生化人终于踏上了归途。

然而，雷普莉的运气实在是不怎么样，看起来她的生活总是不能和异形分开。

他们都没有发现，在飞船上有着一只抱脸虫，因为抱脸虫所带有的腐蚀性破坏了飞船，直接导致这艘飞船在一颗星球坠毁，除却雷普莉之外的所有人因为飞船的坠毁而死去。

这是一颗监狱星球，这个星球的人发现了坠毁的飞船并救回了雷普莉。

雷普莉在飞船的残骸中发现了异形的痕迹，她怀疑飞船中其他人的体内可能有异形的胚胎，所有想办法让监狱的医生对小女孩进行尸检。虽然什么也没有发现，但是雷普莉为了以防万一，最后还是坚持着将所有人的尸体活化。

雷普莉没有想到，虽然飞船中的尸体都没有被异形寄生，但是抱脸虫却袭击了监狱星球的一头牛，不久之后，一只类似于野兽形态的异形从牛的尸体中诞生。

不久之后，一名囚犯在清理通风管道的时候遭遇了异形，因为脸上被喷上了酸性液体，他失足被通风管道的风扇搅碎。

这件事并没有引起监狱长的过多关注，他只是因为，这只不过是因为，这个长期只有男人的星球突然来了雷普莉，所以引起监狱中的囚犯人心浮躁。

事实上，雷普莉一直没有放弃寻找飞船坠毁的真相，她找到了飞船的黑匣子，并在垃圾堆中找到了残破不堪的生化人，借此她终于得知了，飞船是因为抱脸虫的活动而起火并最终坠毁。

与此同时，异形再一次攻击了囚犯，三名囚犯中两名死亡，最后一个人浑身是血，疯疯癫癫的表示是龙之类的东西杀死了那两个人，只不过因为他先前是个杀人犯，所以监狱长并不相信他的话，并且还下令把他绑了起来。

雷普莉告诉监狱长异形的事情，只是监狱长并不相信，并且还把她关进了医疗室中。

直到监狱长在很多囚犯的眼前，直接被天花板上出现的异形抓走，所有人终于相信了雷普莉的话，并听从她的安排对付异形。

在付出了一些牺牲之后，雷普莉他们成功的用火把异形从通风管道中驱赶出来，并最终把异形关进了一间只有一个出口的坚固仓库中。

成功困住异形后，雷普莉向公司发出通讯，并要求杀死异形，只是这并没有被允许，随后公司派出队伍来处理异形。

不过，在公司的人来之前，那个曾经被当做疯子的人彻底疯了。

他把异形当做了自己的神，成功的逃出去后杀死了看管仓库大门的人，只是他眼中的神立刻就杀死了他，并逃出了仓库。